drush php-script user_email_convert.phpгде-нибудь в кишках сайта. Если не знаете, что такое drush, то самое время узнать.
Кстати вот пока разбирался и пытался понять что там вообще к чему, нашёл в модуле user скрипт обновления базы, но почему-то он не сработал... так что может только у меня такая бага?
п.с. замечания и исправления кода приветствуются :)
п.п.с. код в public domain можете делать с ним всё что угодно.